Как я понимаю, одна транспортная единица "приплетена" в Постановление по разработке Инструкции, т.к. в Налоговом кодексе звучит фраза "Объектами налогообложения экологическим налогом не признаются:
хранение отходов производства, предназначенных для захоронения, обезвреживания и (или) использования, в целях накопления количества отходов производства, необходимого для перевозки 
одной транспортной единицей на объекты захоронения, обезвреживания таких отходов и (или) объекты по использованию таких отходов"
Т.е. если придет проверка налоговиков, то ,вероятно, они будут пытаться найти в Инструкции по отходам фразу "одна транспортная единица", а не допустимое количество отходов... Гнедов в своей статье предлагает либо объединить эти два понятия, либо разделить и отдельно установить цифру для "транпортной единицы" и для "допустимого количества".
Отсканированного журнальчика у меня нет, но могу конкретно эту статью отсканировать и прислать, если интересно  

: